W trzecim sezonie twórcy serialu powracają do archetypów, które przyniosły popularność oryginalnym filmom, odkrywają przed widzami nowe fakty ze świata Gwiezdnych Wojen i zabierają ich w niezbadane dotąd obszary galaktyki. Wraz ze zgłębieniem kolejnych tajemnic fani dowiedzą się zupełnie nowych rzeczy na temat swoich ulubionych bohaterów, konfliktu który targa ich światem, a nawet na temat natury Mocy. Nowe Wojny Klonów prezentują historię, która wykracza poza linię działań wojennych.

Od niepewnych sojuszy, przez wątpliwą lojalności do proroctwa o Wybrańcu, seria trzecia Wojen Klonów powraca do korzeni klasycznych Gwiezdnych Wojen. Teraz tajemnice, które wstrząsną galaktyką mogą w końcu zostać ujawnione. Zło przenika w szeregi Republiki, a bohaterowie muszą opowiedzieć się po jednej ze stron. Waleczne klony stają do boju ze śmiercionośnymi droidami. Od treningów na planecie Kamino po pole walki ich braterstwo stało się jednym z nieodzownych elementów Wojen Klonów. Dowodzeni przez szlachetnych Jedi bronią pokoju i sprawiedliwości. Są siłą dobra w galaktyce i źródłem zabawy, pokazują konflikt z perspektywy przeciętnego żołnierza.

Bohaterowie Republiki, do których dołączą niektóre postacie znane fanom z filmów fabularnych, przemierzając nowe tereny galaktyki i odkryją przed widzami nowe historie z uniwersum Gwiezdnych Wojen.

Premiera "Gwiezdne Wojny: Wojny Klonów – Odkryte tajemnice" w Cartoon Network 7 kwietnia 2011 roku o godzinie 19.